86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3327 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 227 aa  453  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  38.17 
 
 		 150 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 138 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  38.71 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  44.32 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  56.34 
 
 		 132 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  37.93 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  50.7 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  50.7 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  48.75 
 
 		 145 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  37.4 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  31.65 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  32.48 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  33.07 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  30.61 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  32.47 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.99 
 
 		 121 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  31.51 
 
 		 162 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  29.93 
 
 		 137 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  27.27 
 
 		 116 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  30.93 
 
 		 113 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2631  ribonuclease P protein component  36.6 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88975  normal  0.0705179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  40.26 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  34.25 
 
 		 121 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  36.99 
 
 		 117 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  36.23 
 
 		 115 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3504  ribonuclease P protein component  36.42 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 116 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  43.59 
 
 		 116 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  43.59 
 
 		 116 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  30.67 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  30.52 
 
 		 131 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  36.27 
 
 		 148 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  39.47 
 
 		 106 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2309  ribonuclease P protein component  35.1 
 
 		 169 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.11 
 
 		 115 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  36.49 
 
 		 165 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.11 
 
 		 115 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.11 
 
 		 119 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.11 
 
 		 119 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.11 
 
 		 119 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.11 
 
 		 119 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.11 
 
 		 119 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  32.88 
 
 		 115 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  34.78 
 
 		 115 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  31.11 
 
 		 115 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  34.25 
 
 		 110 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  39.73 
 
 		 114 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  38.36 
 
 		 116 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  38.36 
 
 		 116 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  36.42 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  48.33 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  38.36 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 107 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  41.07 
 
 		 131 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  32.88 
 
 		 116 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  38.67 
 
 		 93 aa  45.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  34.25 
 
 		 111 aa  46.2  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 		 154 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  44.26 
 
 		 129 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  42.31 
 
 		 116 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  32.05 
 
 		 111 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  33.75 
 
 		 110 aa  45.4  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  33.78 
 
 		 126 aa  45.1  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 		 120 aa  45.1  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  35.66 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  47.37 
 
 		 92 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  42.31 
 
 		 116 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  33.78 
 
 		 115 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  43.75 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  43.86 
 
 		 123 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  30.59 
 
 		 119 aa  42.7  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  30.12 
 
 		 116 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  31.46 
 
 		 126 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  31.68 
 
 		 147 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  44.05 
 
 		 122 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  28.87 
 
 		 129 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 		 130 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  34.01 
 
 		 113 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 113 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  28.21 
 
 		 109 aa  41.6  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  40.54 
 
 		 122 aa  41.6  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>