54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6486 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  55.56 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  50.54 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  51.72 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  56 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  56.92 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  51.14 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  51.95 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  50.59 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  51.81 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  48.75 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  50.62 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  49.3 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  55.38 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  59.7 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  42.5 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  42.5 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  42.5 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  53.25 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  48.53 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  55.38 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  60.56 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  48.53 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  49.45 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  47.3 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  45.83 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  60.94 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  64.71 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  46.25 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  46.88 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  41.94 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  43.24 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  43.24 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  38.64 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  44.74 
 
 		 240 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  40.91 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  32.86 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  56.52 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  41.89 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  37.31 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  36.23 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  43.28 
 
 		 132 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 		 132 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  34.85 
 
 		 117 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  34.57 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.92 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  44.83 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  45.21 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  37.88 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  36.92 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  32.31 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  46.25 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  30.14 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>