111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1060 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 137 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  99.27 
 
 		 137 aa  268  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  92.7 
 
 		 137 aa  254  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  66.15 
 
 		 149 aa  137  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  61.67 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  58.49 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  65.83 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  52.38 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  45.38 
 
 		 240 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  41.82 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  51.92 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  47.57 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  47.83 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  48.54 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  49.51 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  39.82 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  46.6 
 
 		 242 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  40.57 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  44.66 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  45.24 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  38.6 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  47.66 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  40.78 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  38.6 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  42.53 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0300  ribonuclease P protein component  51.82 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  40.78 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  43.81 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  41.67 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  45.88 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  41.67 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  39.05 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  41 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  38.28 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  40 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  29.93 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  43.48 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  33.04 
 
 		 113 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  33 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  45.21 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  33.65 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2139  ribonuclease P protein component  45.54 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  45.21 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  45.21 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2631  ribonuclease P protein component  40.54 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88975  normal  0.0705179 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  43.48 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  40.54 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  24.04 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.63 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  37.35 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.63 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.63 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.63 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.63 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  38.24 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  31.07 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  36.36 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  35.37 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.63 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  35.92 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  30 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  39.51 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2309  ribonuclease P protein component  41.07 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  35.37 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  43.59 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  29.81 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  29.35 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  66.67 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  41.35 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  36.23 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  39.67 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  33.63 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  42.47 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  41.89 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  38.96 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  35.58 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3504  ribonuclease P protein component  43.52 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  40.28 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  67.86 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  47.17 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  32.11 
 
 		 108 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.63 
 
 		 130 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  33.68 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  36.14 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  41.89 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  46.94 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  73.08 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  73.08 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>