92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1047 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  100 
 
 
121 aa  243  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  55.86 
 
 
145 aa  120  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  55.86 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  52.63 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  58.12 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  51.35 
 
 
133 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  47.5 
 
 
133 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  53.21 
 
 
129 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  53.51 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  41.82 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  41.82 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  41.12 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  39.64 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  36.8 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  37.29 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  37.14 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  33.04 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  40.59 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  37.76 
 
 
145 aa  58.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  39.42 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  41.11 
 
 
189 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  44.83 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  46.15 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  48.6 
 
 
187 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  38.05 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  40.91 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  43.52 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  36.26 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  35.62 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32.52 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  34.95 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  36.26 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  53.33 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  39.22 
 
 
242 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  38.3 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  36.26 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  37.23 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  37.23 
 
 
116 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  34.51 
 
 
115 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  42.16 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  42.47 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  34.95 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  42.25 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  42.16 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  35.56 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  34.07 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  34.07 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  48.89 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  38.05 
 
 
174 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  34.07 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  34.07 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  34.07 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  34.07 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  35.8 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  44.29 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  41.89 
 
 
180 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  39.33 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  54.17 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  54.17 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  35.23 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  50 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  50 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  32.17 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  34.86 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  38.6 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  35.63 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  39.22 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  36.63 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  31.62 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2631  ribonuclease P protein component  35.65 
 
 
165 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88975  normal  0.0705179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  40.2 
 
 
113 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  34.45 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  48.89 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  36.62 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  48.08 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  46.67 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  52.78 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  31.36 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  46.81 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  44.68 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  47.83 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  34.85 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>