94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4984 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  100 
 
 
122 aa  230  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  56.45 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  59.82 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  52.17 
 
 
124 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  50.41 
 
 
147 aa  100  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  48.82 
 
 
125 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  61.04 
 
 
91 aa  90.9  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  46.55 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  46.55 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  46.55 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  45.61 
 
 
122 aa  84.3  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  42.74 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  44.92 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  50 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  41.67 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  47.01 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  40.98 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  50.54 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  55.14 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  53.95 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  60.61 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  43.9 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  52.99 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  53.85 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  53.09 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  49.57 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  27.52 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  27.52 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  27.52 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  27.52 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  27.52 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  27.52 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  27.52 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  51.06 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  26.61 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  26.61 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  26.09 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  38.02 
 
 
130 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  33.33 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  36.04 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  27.64 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  36.69 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  26.61 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  51.52 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  38.03 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  35.45 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  28.33 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  35.45 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  34.45 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  47.06 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  52.89 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  33.06 
 
 
116 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  30.58 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  33.33 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  25.69 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  29.31 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  33.33 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  38.61 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  38.33 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  28.12 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  30.65 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  36.92 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.62 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  37.62 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  22.41 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  23.08 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  35.04 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  22.69 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  52.1 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  29.36 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  29.66 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  23.68 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  42.42 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  26.53 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  45.16 
 
 
133 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  25.69 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  26.96 
 
 
121 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  49.25 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  34.43 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  34.18 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  43.9 
 
 
227 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  24.24 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  32.2 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  27.83 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  22.68 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  22.68 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  27.17 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  22.35 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  36.23 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  34.78 
 
 
119 aa  40  0.01  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>