185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3644 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  46.55 
 
 		 135 aa  116  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  38.32 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  42.99 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  38.1 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  34.58 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  37.61 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  32.48 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  36.7 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  35.09 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  35.09 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  31.82 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  31.3 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  39.45 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  38.04 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  43.18 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  47.62 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  33.33 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  33.33 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  29.81 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  38.05 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  41.57 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  42.53 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  29.9 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  31.36 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  31.36 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  31.63 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  32.17 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  36.75 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  33.04 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  39.56 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  29.91 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  34.48 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  39.13 
 
 		 132 aa  57  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  31.19 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  32.11 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  33.04 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  32.04 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  33.33 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  29.91 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  36.36 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  31.36 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  35 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  29.73 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  27.93 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  29.73 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  35.71 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  34.82 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  29.06 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  28.83 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  29.91 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  29.91 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  33.77 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  29.91 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  30.56 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  29.91 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1229  ribonuclease P protein component  37.7 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0151351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  29.91 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  29.91 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  29.91 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.82 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  29.91 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  34.69 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  39.29 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.82 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.25 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.25 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.25 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2146  ribonuclease P protein component  31.53 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164935  unclonable  0.0000011472 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.25 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.25 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  29.73 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  31.53 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  57.78 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  28.83 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  31.31 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  30.56 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  28.97 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  27.93 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  27.93 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  27.93 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  29.13 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  29.82 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>