194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1790 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  61.11 
 
 		 109 aa  140  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  59.46 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  49.06 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  50.91 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  49.06 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  48.11 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  47.17 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  49.06 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  47.17 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  47.17 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  47.17 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  47.17 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  47.17 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  47.17 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  48.18 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  48.18 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  46.23 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  51.82 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  47.75 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  47.42 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  42.48 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  39.29 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  42.31 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  42.31 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  38 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  34.55 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  33.98 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  28.18 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  33.94 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  33.02 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  33.96 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  32.08 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  33.68 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  34.38 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  41.18 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  31.19 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  34.07 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  35.19 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  34.26 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  34.69 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  42.35 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  33.72 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  34.29 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  34.12 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  33.68 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  42.11 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.95 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  31.19 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  31.43 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  42.65 
 
 		 240 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  31.91 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  38.67 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  39.47 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  31.19 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  34.58 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  28.85 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  31.63 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  35.48 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  35.94 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  30 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  31.31 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  29.29 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  34.62 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  33.02 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  30.56 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0001  ribonuclease P protein component  29.81 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0001269  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  31.48 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  32.53 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  31.25 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  30.84 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  31.25 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  31.25 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  36.36 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  43.33 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  30.61 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  28.97 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  28.97 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  29.47 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  28.97 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  36.21 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  34.18 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  29.46 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  29.91 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>