61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0552 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  50.93 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  58.75 
 
 		 81 aa  96.7  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  56.25 
 
 		 80 aa  96.3  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1621  hypothetical protein  59.02 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0650  ribonuclease P protein component (RNaseP protein) (RNaseP protein) (protein C5)  44.93 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.963199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  35.85 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  32.71 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  42.42 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  34.69 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  34.91 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  36.84 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  36.19 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  30.1 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  32.04 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  33.66 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  33.66 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  33.02 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.68 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  33.33 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  33.33 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.68 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  31.68 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.68 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.68 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.68 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.68 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.68 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  32.04 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  26.36 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  29.13 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  28.12 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  35.06 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  26.32 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  33.75 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  33.33 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  33.71 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  41.79 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  33.71 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  31.58 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  24.71 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  29.47 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  27.37 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  28.04 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  28.04 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  32.41 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  42.55 
 
 		 120 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 109 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  31.13 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  26.32 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  26.32 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  24.73 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>