107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0766 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  100 
 
 
123 aa  246  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1424  ribonuclease P protein component  51.85 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18331  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3966  ribonuclease P protein component  50 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142048  normal  0.0834112 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  34.75 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1195  ribonuclease P protein component  46.09 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000104376  decreased coverage  0.00023065 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  33.9 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  30.58 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  30.58 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  31.62 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  28.18 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31.86 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  26.89 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  30.25 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  30.43 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  24.55 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  28.81 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  28.57 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  36.45 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  29.2 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  28.91 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  29.75 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  34.86 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  27.19 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  27.19 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  27.1 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  27.36 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  28.95 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  25.45 
 
 
115 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  25.45 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  44.26 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  29.73 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  38.67 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  24.55 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  23.64 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  23.64 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  23.64 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  23.64 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  23.64 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  23.64 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  33.94 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  33.94 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  30.89 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  29.51 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  29.51 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  26.72 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  25.21 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  23.64 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  29.84 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  33.03 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  33.03 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  25.74 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  25.93 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.71 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  34.51 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  40.7 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  33.01 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  35.48 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  29.25 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  33.03 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  40.7 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  37 
 
 
152 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  33.67 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  37.18 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  41.57 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  26.61 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  29.81 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  26.17 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  30.84 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  28.95 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  44.9 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  36.62 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  39.06 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  26.67 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  32.84 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  32.84 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  32.84 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  30.28 
 
 
118 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  31.19 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  34.04 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  31.19 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  27.97 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  32.98 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  30.86 
 
 
110 aa  42  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0001  ribonuclease P protein component  29.36 
 
 
123 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0001269  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
189 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  26.27 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  30.63 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  28.43 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  32.84 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  26.92 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  40.82 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>