166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4044 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 152 aa  296  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  65.22 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  50.45 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  50 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  42.06 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  42.99 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  36.7 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  36.7 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  37.11 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  35.51 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  38.54 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  31.53 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  36.7 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  31.03 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  34.58 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  34.58 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  34.58 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  33.64 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  33.64 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  40.16 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  33.64 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  33.64 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  33.64 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  33.64 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  33.64 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  33.64 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  26.17 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  31.2 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  32.71 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  31.73 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  29.82 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  32.71 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  26.17 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4016  ribonuclease P protein component  32.2 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116419  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  26.17 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  26.17 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  26.17 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  26.17 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  26.17 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  29.31 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  26.17 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  26.17 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  34.75 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  33.59 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  35.19 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0001  ribonuclease P protein component  26.96 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0001269  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  27.59 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  43.01 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  30.84 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  43.01 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  34.75 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  41.57 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  39.62 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  30.84 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  26.17 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  34.48 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  26.92 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4203  ribonuclease P protein  36.9 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0154701  decreased coverage  0.00202105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  25.23 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  34.91 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  34.91 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  37.82 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  38.27 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  34.91 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  34.91 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  34.91 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  34.91 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  33.03 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3217  ribonuclease P protein component  34.83 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  34.91 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  31.3 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  31.13 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  27.93 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  32.71 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  31.78 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  32.11 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  32.04 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2551  ribonuclease P protein component  32.58 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  29.52 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3165  ribonuclease P protein component  32.58 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  33.94 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3156  ribonuclease P protein component  35.8 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  31.93 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  32.2 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  29.41 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  37.38 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  31.9 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  33.02 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>