64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1863 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  100 
 
 		 122 aa  248  1e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  52.1 
 
 		 116 aa  127  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  40.34 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  44.63 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  44.63 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  43.22 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  39.83 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  41.59 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  42.61 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  41.74 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  42.61 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  42.61 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  42.61 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  42.61 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  42.61 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  42.61 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  42.86 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  39.29 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  40.87 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  40.87 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  37.61 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  35.4 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  41.75 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  37.5 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  39.77 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  36.61 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  41.57 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  30.63 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  31.82 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  31.82 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  38.37 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  36.14 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  34.94 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  28.32 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  28.24 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  29.7 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  29.46 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  30.39 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  32.77 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  32.86 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  31.82 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  32.86 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  31.67 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  29.82 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  30.48 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  25.81 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  28.87 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  26.67 
 
 		 123 aa  42  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  28.43 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  29.76 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  26.19 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  30 
 
 		 120 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  27.69 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  34.18 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  25.89 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  37.93 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>