115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0869 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 109 aa  205  1e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  46 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  44.86 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  44.86 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  44.86 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  44.86 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  44.86 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  43.93 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  44.86 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  44.86 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  42.06 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  42.99 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  42.99 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  42.99 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  40.57 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  42.22 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  43.68 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  43.68 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  37.5 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  35.24 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  25.69 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  32.08 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  36 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  32.71 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  29.9 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  34.74 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  36.36 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf882  ribonuclease P protein component  36.46 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 		 115 aa  57  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  30.39 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  27.06 
 
 		 240 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  25.51 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  31.68 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  23.16 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  34.15 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  34 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  30.1 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  26.85 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  31.37 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  25.69 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  28 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  23.08 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  24.04 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  23.23 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  24.04 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  32.63 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  26.67 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  35.09 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  24.51 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  26.92 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  30.86 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  28.57 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  26.87 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  35.53 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  35.53 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  34.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  32.67 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  34.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  34.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  34.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  34.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  34.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  34.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  34.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  27.1 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  34.21 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  32.1 
 
 		 134 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  26.42 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  27.78 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  34.21 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  24.42 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  32.11 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3462  ribonuclease P protein component  28.92 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  32.93 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  21.57 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  38.03 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  28.57 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32.43 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  24.42 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  21.33 
 
 		 93 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  27.1 
 
 		 145 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  32.89 
 
 		 120 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 		 129 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  28.85 
 
 		 109 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  28.21 
 
 		 227 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  34.15 
 
 		 117 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  26.37 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  35.53 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  30.23 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  26.89 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  29.91 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>