176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3945 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  100 
 
 		 116 aa  228  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  42.45 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  43.12 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  44.55 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  44.55 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  53.75 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  44.34 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.04 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  40.57 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  44.55 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  44.55 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  44.55 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  44.55 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  44.55 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  44.55 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  44.55 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  41.51 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  42.57 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  42.57 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  39.62 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  39.62 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  39.6 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  42.57 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  42.57 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  38.38 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  38.95 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  38.37 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  36.54 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  38.37 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  36.27 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  35.34 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  35.51 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  37.5 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  37.5 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  36 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  35.58 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  33.04 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  33.96 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  37.78 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  31.07 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  38.57 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  37.04 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  39.51 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  30.25 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  36.99 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  33.63 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  32.11 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  37.27 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  31.48 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  34.69 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  37.11 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  37.04 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  32.14 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  38.55 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  38.39 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  39.29 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  38.39 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  38.39 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  37.07 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  27.36 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  26.61 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  38.94 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  38.39 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  44.59 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  38.68 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  30.91 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  36.59 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  34.21 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  30.91 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  38.38 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  34.21 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  34 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  38.46 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  27.37 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  32.67 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  32.67 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  32.67 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  28.38 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  36.92 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  31.76 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  39.73 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  30.95 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  30.61 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  31.33 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  31.33 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  32.29 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>