147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2396 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  58.49 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  50.94 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  55.43 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  53.16 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  30.68 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  30.68 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  30.68 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  30.68 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  29.55 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  29.55 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  29.55 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  29.55 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  29.55 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  29.55 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  29.55 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  34.13 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  32.08 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  31.75 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  39.73 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  34.09 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  29.55 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  35.05 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  36.21 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  34.65 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  40.23 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  34.75 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  31.25 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  34.69 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  29.55 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  25.89 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  25.89 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  26.61 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  43.94 
 
 		 170 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  45.16 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  33.66 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  45.16 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  34.38 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  25.89 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  38.2 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  35.48 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  29.91 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  32.89 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  28.74 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  28.8 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  34.48 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  33.88 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  31.82 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  32.05 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  32.76 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  32.18 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  35.16 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  37.21 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.71 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  28.24 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  35.82 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  36.14 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  25.66 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  34.48 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  42.19 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  25.27 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  25.88 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  27.17 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  36.73 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  39.76 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  39.81 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  30 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  32.23 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  23.48 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  33.06 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  32.93 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  34.19 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  36.78 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  35.23 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  46.55 
 
 		 119 aa  43.5  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  24.71 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  29.75 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  27.5 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2413  ribonuclease P protein component  34.02 
 
 		 123 aa  42  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0343106  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  23.6 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  35.63 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  39.6 
 
 		 121 aa  42  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>