118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2315 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  100 
 
 		 121 aa  241  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  98.35 
 
 		 121 aa  236  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  49.45 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  48.24 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  33.33 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  39.39 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  39.39 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  39.39 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  39.39 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  39.39 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  39.39 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  33.93 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  38.38 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  38.38 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  38.38 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4016  ribonuclease P protein component  36.73 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116419  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  36.63 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  36 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  37.37 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  38.38 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  38.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  38.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  38.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  38.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  38.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  35 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  36.36 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  35.42 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  32.67 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  44.93 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  37.07 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  38.78 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  43.28 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  34.69 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  34.69 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  35.71 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  34.38 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  41.57 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  41.79 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  41.79 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  33.67 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  33.67 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  40 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  39.22 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  39.73 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  33.67 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  33.67 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  33.67 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  33.67 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  32.65 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  33.67 
 
 		 118 aa  48.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  32.65 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  32.65 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  32.65 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  28 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  33.67 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  45.61 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  26.42 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  26.42 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  26.42 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  26.42 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  39.71 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  27 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  26.42 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  27 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  37.31 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2826  ribonuclease P protein component  49.09 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  38.81 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  26 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  41.77 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  40.3 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  38.57 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  42.03 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  30 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  26 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2146  ribonuclease P protein component  34.33 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164935  unclonable  0.0000011472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  40.51 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  32.41 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  27 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  39.81 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2413  ribonuclease P protein component  29.81 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0343106  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  37.31 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  38.75 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0001  ribonuclease P protein component  34.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0001269  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  40.51 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  34.15 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  29.29 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2778  ribonuclease P protein component  43.86 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.07678  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  33 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  36.92 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  35.82 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  32.63 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  36.92 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  36.92 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  28.57 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>