70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1919 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 92 aa  183  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  70.65 
 
 		 180 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  55.43 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  53.57 
 
 		 130 aa  87  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  49.37 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  54.55 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  34.57 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  39.44 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  42.67 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  46.38 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  46.25 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  48 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  43.14 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  42 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  42 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  57.14 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  42.22 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  37.7 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  42.11 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  51.16 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  35.21 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  54.55 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  41.86 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  30.99 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  39.74 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  42.55 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  55.56 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  55.56 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  54.55 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  50 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  42.86 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  45.1 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  37.78 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  50 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  45.83 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  53.33 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  51.22 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  52.27 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  54.84 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  61.11 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  50 
 
 		 118 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  50 
 
 		 119 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  56.52 
 
 		 128 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  42.03 
 
 		 119 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  42.22 
 
 		 115 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  45.83 
 
 		 116 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  51.06 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  58.33 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  52.78 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  45.24 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1229  ribonuclease P protein component  41.27 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0151351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  42.37 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  46.94 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  46.34 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  46.94 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  52.27 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  46.94 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  40.68 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  47.5 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  44.44 
 
 		 116 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  44.44 
 
 		 121 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  52.27 
 
 		 118 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  52.27 
 
 		 118 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  52.27 
 
 		 118 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>