164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4137 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  100 
 
 
107 aa  207  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  46.73 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  40.57 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  39.81 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  39 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  39.62 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  35.05 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  31.37 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  34.62 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  34.02 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  37 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  40 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  38.27 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  34.44 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  38.78 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  33 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  37.76 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  33.73 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  34.09 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  31.52 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  31.33 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  37.76 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  30 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  32.95 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  35 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  38.27 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  26.67 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  33.33 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  34.48 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  36.25 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  31.31 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  31 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  24.47 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  33.33 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  31 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  42.19 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  33.7 
 
 
125 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  33.7 
 
 
125 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  30.3 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  32.08 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  40.91 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  32.94 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  27.5 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  39.02 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  28.75 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  36.26 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  33.65 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  37.97 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  26.53 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  32.93 
 
 
129 aa  50.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  41.18 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  29.59 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  31 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  30 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  30 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  30 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  30 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  30 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  30 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  30 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  30 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  53.33 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  31 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  30 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  31.91 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  32.5 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  27.38 
 
 
114 aa  48.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
137 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  32.5 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  25.69 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  37.7 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  36.21 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  31.71 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  33.33 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  32.61 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  30.85 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  35 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  34.15 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>