52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1368 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 107 aa  216  8.999999999999998e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  41.46 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  31 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  29.52 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  31 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  30.1 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  35.8 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  29.17 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  26.53 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  30.21 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  30 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  30.21 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  30.21 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  30.21 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  30.21 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  29.17 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  29.17 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  29.17 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  29.17 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  29.29 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  28.12 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  26.26 
 
 		 117 aa  43.9  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  37.35 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  26.26 
 
 		 117 aa  43.9  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  34.91 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  31 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  26.26 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  28.12 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  32.53 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  25.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  26.67 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  45.28 
 
 		 132 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  25.71 
 
 		 115 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  26.21 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  25.71 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  25.71 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  25.71 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  25.71 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  28.12 
 
 		 118 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  25.71 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  30.48 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  26.67 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  26.47 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  30.53 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  27.55 
 
 		 119 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  31.96 
 
 		 136 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>