71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0522 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  100 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  47.83 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  46.38 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  46.38 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  42.42 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  44.93 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1621  hypothetical protein  49.18 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  42.42 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  45.95 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0650  ribonuclease P protein component (RNaseP protein) (RNaseP protein) (protein C5)  34.78 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.963199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  35.48 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  37.35 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  36.92 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  33.87 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  36.23 
 
 		 111 aa  48.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  43.28 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  33.82 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  36.92 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  38.81 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  38.24 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  32.39 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  34.85 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  38.89 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  37.88 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  39.06 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  40 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  38.57 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  33.8 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  33.8 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  80 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  32.31 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  36.76 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  44.68 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  34.38 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  34.85 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  28.17 
 
 		 116 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  37.1 
 
 		 129 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  36.92 
 
 		 162 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  31.51 
 
 		 115 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  33.33 
 
 		 117 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  34.33 
 
 		 106 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  33.33 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  30.99 
 
 		 113 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  30.77 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  31.65 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  42.22 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  32.89 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  28.57 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  29.87 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  32.39 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  32.89 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  40.82 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  36.23 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  30.65 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  30.99 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  36.92 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  36.92 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  35.38 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  30.77 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  30.77 
 
 		 119 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  30.77 
 
 		 119 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  30.77 
 
 		 119 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  30.77 
 
 		 119 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  30.77 
 
 		 115 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  30.77 
 
 		 119 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>