39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_14200 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  100 
 
 
112 aa  236  5e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  60 
 
 
108 aa  130  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  29.36 
 
 
115 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  36.49 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  28.83 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.96 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  26.97 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  30.1 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  35.29 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  33.85 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  28.16 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  24.27 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  30.93 
 
 
115 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  30.93 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  30.93 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  30.93 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  30.93 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  30.93 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  36.21 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  36.07 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  30 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  27.18 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  36.21 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  32.91 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  26.09 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
189 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  23.23 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  36.99 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0650  ribonuclease P protein component (RNaseP protein) (RNaseP protein) (protein C5)  31.25 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.963199  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  60 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  29.9 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>