79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0641 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  100 
 
 
148 aa  295  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  56.03 
 
 
189 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  55.42 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  46.73 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  46.15 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  45.3 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  46.46 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  42.31 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  38.26 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  54.26 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  39.32 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  45.98 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  40.2 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  36.89 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  39.66 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0300  ribonuclease P protein component  47.29 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  42.73 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  44.83 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  38.14 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  42.86 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  42.86 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  40.91 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  41.51 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  40.7 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  40.7 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  37.7 
 
 
242 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  35 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  36.05 
 
 
116 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  43.81 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  38.67 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  40.48 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  38.16 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  39.53 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  29.48 
 
 
227 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  37.35 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  41.8 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  42.65 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  53.57 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  55.32 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  31.53 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  34.94 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3504  ribonuclease P protein component  43.12 
 
 
206 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  40.3 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  28.93 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  34.26 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  39.25 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  36.9 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  41.84 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  36.05 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  36.67 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.21 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  43.48 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  30.25 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  30.23 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  33.75 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  34.29 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  65.52 
 
 
115 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  41.51 
 
 
125 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  41.79 
 
 
135 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  36 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  47.83 
 
 
116 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  33.78 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  31.19 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  31.19 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  36.99 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  34.09 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  60.71 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  34.33 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  33.78 
 
 
121 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>