64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1256 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 115 aa  234  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  34.34 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  35.19 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  29.67 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  30.48 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  30.36 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  38.64 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  31.3 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  33 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  36.36 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.11 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  38.2 
 
 		 129 aa  48.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  31.46 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.11 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  32.48 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.52 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.11 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.11 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.11 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.11 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.11 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  30.61 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  26.67 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  28.57 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  31.11 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  27.08 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  29.79 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  28 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2523  ribonuclease P protein component  44.87 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0265349  hitchhiker  0.0000065266 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  30.34 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  31.11 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  36.56 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  27.27 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  38.24 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  30 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  32.31 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  25.47 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  33.78 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  32.88 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  26.53 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  35.8 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  38.6 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  37.84 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  41.89 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  37.5 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  37.5 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  43.33 
 
 		 162 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  33.66 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  36.36 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  38.6 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  28.72 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  45.24 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  35.42 
 
 		 119 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>