114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4224 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 119 aa  226  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  57.89 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  49.07 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  50.94 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  47.01 
 
 		 122 aa  90.5  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  50.89 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  48.6 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  48.6 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  48.6 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  56.19 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  47.71 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  57.5 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  47.22 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  56.19 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  45.45 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  44.83 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  64.06 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  47.71 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  46.9 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  51.69 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  44.34 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  50.89 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  30.63 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  28.83 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  51.81 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  54.67 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  36.73 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  34.65 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  34.65 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  34.65 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  34.65 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  34.65 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  48.11 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  34.65 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  34.65 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  30.97 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  30.97 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  38.04 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.61 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  42.72 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  52.05 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  26.42 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  26.42 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  56.96 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  51.89 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  27.64 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  29.82 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  41.18 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  35.34 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  40.24 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  29.41 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  38.53 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  27.42 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  50.85 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  40.24 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  33.73 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  30.58 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  25.71 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  33.87 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  49.18 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  37.86 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  33.63 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  38.1 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  45.59 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  32.08 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  28.33 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  34.94 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  40.48 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  42.15 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  34.18 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  40.62 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  40.62 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  47.89 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  28.43 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  43.08 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  39.73 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  35.94 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  25.41 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  43.24 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  43.94 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  43.94 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  45.38 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  30.97 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  36.36 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  43.94 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  56.76 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  31.08 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  51.16 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35.59 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>