36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0552 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 81 aa  158  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  63.75 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  64.2 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  64.2 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  62.96 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  58.75 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1621  hypothetical protein  62.3 
 
 		 61 aa  83.6  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0650  ribonuclease P protein component (RNaseP protein) (RNaseP protein) (protein C5)  43.48 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.963199  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  42.42 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  40 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  32.94 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  34.52 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.76 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.76 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.76 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.76 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.76 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.76 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.76 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  31.76 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  30.86 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  35.8 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  36.59 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  31.76 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  36.21 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  39.66 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  38.75 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  37.31 
 
 		 121 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  35.8 
 
 		 109 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  31.65 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  31.65 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  29.49 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  39.34 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  30.3 
 
 		 113 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 145 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>