136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3966 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3966  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142048  normal  0.0834112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1424  ribonuclease P protein component  86.67 
 
 		 122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  38.66 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  38.33 
 
 		 120 aa  84.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1195  ribonuclease P protein component  51.72 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000104376  decreased coverage  0.00023065 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  37.82 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  37.62 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  29.82 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  31.3 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  30.97 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  30.43 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  30.43 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  30.43 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  31.3 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  30.43 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  30.43 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  30.43 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  32.74 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  29.73 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  29.73 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  26.21 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  29.73 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  29.73 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  29.46 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  31.13 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  28.83 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  31.01 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  44.93 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  29.2 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  29.2 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  29.55 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  33.72 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  36.56 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  23.85 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  45.33 
 
 		 227 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  44.78 
 
 		 240 aa  52  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  47.27 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  32.35 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  38 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  31.46 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  56.25 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  27.03 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  37.5 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  35.87 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  46.77 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  31.63 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  37.5 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  25.41 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  27.05 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  28.69 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  25.41 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  31.65 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  41.79 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  35.96 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  26.55 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  32.23 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  49.09 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  24.32 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  30.77 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  46.55 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  25.45 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  27.03 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  33 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2413  ribonuclease P protein component  29.52 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0343106  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  31.17 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  25.42 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  40.7 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  51.06 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  25.93 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  32.35 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  27.35 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  33.71 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  48 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  36.25 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  42.67 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  32.41 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  32.35 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  32.69 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  33.04 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  34.83 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  35.71 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.65 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>