154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0356 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 116 aa  220  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  55.24 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  50.96 
 
 		 240 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  49.51 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  49.51 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  48.54 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  49.51 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  51.69 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  46.6 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  45.05 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  48.65 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  49.5 
 
 		 242 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  49.04 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  32.73 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  43.93 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  52.29 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  32.73 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  32.73 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  32.73 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  32.73 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  32.73 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  32.73 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  32.73 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2139  ribonuclease P protein component  46 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  32.73 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  43.52 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  39.13 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  31.82 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  39.13 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  42.31 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  29.46 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  29.46 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  36.11 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  33.04 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  46.46 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  31.82 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  44.14 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  32.11 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  46.59 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  44.44 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  32.69 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  43.64 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  44.44 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  44.23 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  44.34 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  34.91 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  35.24 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  46.6 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  31.78 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  31.9 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  46.6 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  31.25 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  28.18 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  32.11 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  54.55 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  31.25 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  44.87 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  47.14 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  38.2 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  38.32 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  35.35 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  37.27 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  39.51 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  34.82 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0300  ribonuclease P protein component  50.55 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  37.38 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  37.38 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  37.38 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  42.7 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  29.36 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  47.06 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  38.82 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  31.13 
 
 		 227 aa  53.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  35 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  39.77 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  32.17 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  32.17 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  30.28 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  34.55 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  43.84 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  44.78 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  40.7 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  38.61 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  36.46 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  28.68 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  34.82 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  35.4 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  38.46 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  28.18 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  44.16 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>