113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0300 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0300  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 134 aa  263  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  52.73 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  52.73 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  51.82 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  47.29 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  41.22 
 
 		 189 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  49.52 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 187 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  47.57 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  40.16 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  40.31 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  42.34 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  41.07 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  40 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  40.38 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  52.86 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  50.49 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  47.83 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  40.15 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  43.64 
 
 		 242 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  41.41 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  40.54 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  38.18 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  35.92 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  39.36 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  41.18 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  36.52 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  37.74 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  34.72 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  35.24 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  47.56 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  41 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  38 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  31.15 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2139  ribonuclease P protein component  46.6 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  33.01 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  37.21 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  27.36 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  41.25 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  29.37 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  29.37 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  29.37 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  29.37 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  30.39 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  29.37 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  43.06 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  30.28 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  46.38 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  40.26 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  30.39 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  29.41 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  29.41 
 
 		 115 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  40.23 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  37.88 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  27.27 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  29.41 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  29.27 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  35.37 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3504  ribonuclease P protein component  35.09 
 
 		 206 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  49.18 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  37.3 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  34.91 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  32.89 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  29.13 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  44.78 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  58.97 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  38.14 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.01 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2309  ribonuclease P protein component  37.12 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  28.92 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  38.71 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  38.33 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  38.16 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  30 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  41.67 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  28.1 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  42.17 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  50 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  30.68 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  31.11 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  39.06 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  30.48 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  32.73 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  60.61 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  60.61 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  29.79 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  46.77 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  60 
 
 		 91 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  27.68 
 
 		 119 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>