24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1615 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1615  ribonuclease P  100 
 
 		 122 aa  239  7e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.166425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  35.51 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  40 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  36 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  34.78 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  35.54 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  37.98 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  34.43 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  35.37 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13561  ribonuclease P protein component  28.79 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  32.5 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12711  ribonuclease P protein component  27.74 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373516 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16581  ribonuclease P protein component  32.28 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13771  ribonuclease P protein component  29.77 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.805452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13851  ribonuclease P protein component  31.3 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.91647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0803  ribonuclease P protein component  31.5 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1285  ribonuclease P protein component  29.01 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.240066  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  29.06 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  26.97 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  25 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0579  ribonuclease P protein component of ribozyme  34.92 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  25 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>