More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2338 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5293  2-isopropylmalate synthase  77.98 
 
 		 566 aa  876    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  59.71 
 
 		 576 aa  665    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  58.57 
 
 		 570 aa  655    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  56.89 
 
 		 568 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  58.2 
 
 		 570 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1687  2-isopropylmalate synthase  66.55 
 
 		 555 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  59.74 
 
 		 569 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  59.36 
 
 		 570 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1292  2-isopropylmalate synthase  82.8 
 
 		 558 aa  947    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2338  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 558 aa  1140    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  59.64 
 
 		 562 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  59.74 
 
 		 570 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  57.93 
 
 		 572 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  58.2 
 
 		 570 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  59.93 
 
 		 567 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  59.74 
 
 		 570 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  57.93 
 
 		 572 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  59.74 
 
 		 570 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0019  2-isopropylmalate synthase  66.42 
 
 		 587 aa  734    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  55.41 
 
 		 563 aa  630  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  54.84 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  54.48 
 
 		 592 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  53.79 
 
 		 556 aa  611  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  52.15 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  52.15 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  55.42 
 
 		 565 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  51.97 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  51.97 
 
 		 557 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  54.77 
 
 		 571 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  52.44 
 
 		 556 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  52.41 
 
 		 567 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  52.88 
 
 		 556 aa  600  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  53.55 
 
 		 557 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  52.52 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  53.05 
 
 		 557 aa  599  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  53.05 
 
 		 557 aa  599  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  52.27 
 
 		 585 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  52.44 
 
 		 559 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  52.53 
 
 		 575 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  52.31 
 
 		 563 aa  594  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  52.16 
 
 		 566 aa  589  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  53.62 
 
 		 566 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  52.13 
 
 		 569 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  54.01 
 
 		 559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  53.43 
 
 		 553 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  51.54 
 
 		 549 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  51.61 
 
 		 556 aa  578  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  54.62 
 
 		 571 aa  579  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  52.76 
 
 		 577 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0304  2-isopropylmalate synthase  52.88 
 
 		 551 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  50.36 
 
 		 558 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  52.07 
 
 		 565 aa  566  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  49.91 
 
 		 576 aa  567  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  51.18 
 
 		 554 aa  567  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  50.63 
 
 		 556 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 		 586 aa  559  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  50.44 
 
 		 607 aa  557  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 		 577 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  50.62 
 
 		 581 aa  557  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  51.25 
 
 		 580 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0400  2-isopropylmalate synthase  49.19 
 
 		 558 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 575 aa  548  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  50.98 
 
 		 569 aa  550  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  49.29 
 
 		 584 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_004310  BR1566  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 555 aa  541  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  48.95 
 
 		 590 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0489  2-isopropylmalate synthase  62.53 
 
 		 548 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1513  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 575 aa  542  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  48.92 
 
 		 568 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2823  2-isopropylmalate synthase  61.84 
 
 		 548 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2730  2-isopropylmalate synthase  62.53 
 
 		 548 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  49.29 
 
 		 598 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2198  2-isopropylmalate synthase  61.84 
 
 		 548 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  48.61 
 
 		 585 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2872  2-isopropylmalate synthase  62.53 
 
 		 548 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2812  2-isopropylmalate synthase  61.84 
 
 		 548 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  48.21 
 
 		 569 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6142  2-isopropylmalate synthase  62.07 
 
 		 548 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 595 aa  538  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  48.34 
 
 		 580 aa  535  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  48.4 
 
 		 584 aa  537  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0459  2-isopropylmalate synthase  61.61 
 
 		 546 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  48.92 
 
 		 576 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1599  2-isopropylmalate synthase  48.91 
 
 		 573 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471841  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  47.19 
 
 		 622 aa  535  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2913  2-isopropylmalate synthase  60.96 
 
 		 546 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3135  2-isopropylmalate synthase  60.96 
 
 		 546 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0734  2-isopropylmalate synthase  60.96 
 
 		 546 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  47.18 
 
 		 617 aa  535  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0551  2-isopropylmalate synthase  60.73 
 
 		 546 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2319  2-isopropylmalate synthase  48.48 
 
 		 562 aa  531  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1484  2-isopropylmalate synthase  60.96 
 
 		 546 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0104  2-isopropylmalate synthase  60.96 
 
 		 546 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0567  2-isopropylmalate synthase  60.96 
 
 		 546 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  47.52 
 
 		 601 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1890  2-isopropylmalate synthase  48.29 
 
 		 552 aa  529  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  47.99 
 
 		 598 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  47.52 
 
 		 601 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2190  2-isopropylmalate synthase  49.55 
 
 		 570 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  47.52 
 
 		 601 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>