More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  100 
 
 		 204 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  62.69 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  62.69 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  62.19 
 
 		 204 aa  241  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  62.19 
 
 		 204 aa  241  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  61.58 
 
 		 204 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  61.58 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  61.58 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  61.08 
 
 		 204 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  61.08 
 
 		 204 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  64.22 
 
 		 207 aa  238  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  59.2 
 
 		 207 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  57.71 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  54.68 
 
 		 204 aa  200  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  61.08 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  60.74 
 
 		 166 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  60.74 
 
 		 166 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  58.9 
 
 		 166 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  42.06 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  41.47 
 
 		 248 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  46.04 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  37.25 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  39.59 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  38.24 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  35.15 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  31.84 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  35.47 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  39.87 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0075  peptide chain release factor 2  30.77 
 
 		 282 aa  86.7  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00578068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  28.85 
 
 		 367 aa  85.5  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  35.47 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  34.87 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23862  predicted protein  56.76 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  33.15 
 
 		 361 aa  82.4  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  30.95 
 
 		 349 aa  82  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  39.44 
 
 		 375 aa  82  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  32.14 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  32.37 
 
 		 361 aa  82  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  34.12 
 
 		 376 aa  81.6  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  51.95 
 
 		 354 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  32.14 
 
 		 349 aa  81.3  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  31.28 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  30.36 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  33.95 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  30.86 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  46.25 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  30.86 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  30.86 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  30.92 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  35.67 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  30.29 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  30.95 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  32.35 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  30.86 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  30.86 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  31.46 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  31.46 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  47.78 
 
 		 360 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  30.77 
 
 		 371 aa  79  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  34.03 
 
 		 359 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  30.86 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  30.86 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  32.69 
 
 		 362 aa  79  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  31.55 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  38.46 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0169  peptide chain release factor 2  31.79 
 
 		 380 aa  79  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0400859  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  30.29 
 
 		 406 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  30.86 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  54.05 
 
 		 360 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  35.97 
 
 		 376 aa  79  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0922  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 363 aa  78.6  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.276919  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  30.86 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  31.46 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 375 aa  79  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  35.46 
 
 		 362 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  31.55 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  35.46 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  50.65 
 
 		 357 aa  78.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  35.46 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  47.78 
 
 		 354 aa  78.2  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  34.36 
 
 		 330 aa  78.2  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  35.46 
 
 		 357 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  38.3 
 
 		 344 aa  78.2  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  35.67 
 
 		 341 aa  78.2  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  36.17 
 
 		 323 aa  77.8  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  45.65 
 
 		 357 aa  77.8  0.00000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  33.51 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  34.75 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  31.55 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  31.02 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  35.71 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  30.95 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  30.51 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  31.58 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  30.95 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  31.35 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  46.32 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  51.35 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  44.79 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  34.94 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>