53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  88.51 
 
 		 149 aa  255  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  57.33 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  42.66 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  37.82 
 
 		 189 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  37.82 
 
 		 189 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 		 189 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  37.33 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  37.33 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  37.33 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  37.33 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  37.33 
 
 		 196 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  37.33 
 
 		 196 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  37.82 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  37.33 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  37.33 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  37.82 
 
 		 189 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  37.75 
 
 		 182 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  38.51 
 
 		 210 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  35.95 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  35.76 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  35.1 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  35.42 
 
 		 187 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  34.48 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  35.33 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  48.57 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  45.83 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  39.24 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  40.85 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  40.85 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  39.13 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  33.77 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  46.15 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  46.15 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  44.44 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  28.46 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1322  general secretion pathway protein H  36.07 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0535  general secretion pathway protein H  38.75 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3129  general secretion pathway protein H  47.22 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  34.41 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  30.32 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  30.32 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  30.32 
 
 		 169 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  54.35 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1080  general secretion pathway protein H  45.31 
 
 		 154 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  39.68 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  29.68 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  29.68 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  53.19 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  56.76 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  29.06 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>