More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55360 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  94.47 
 
 		 608 aa  1077    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  72.82 
 
 		 599 aa  900    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  100 
 
 		 615 aa  1231    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.05 
 
 		 598 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.03 
 
 		 594 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.51 
 
 		 585 aa  545  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.49 
 
 		 655 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.46 
 
 		 671 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.52 
 
 		 680 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.97 
 
 		 603 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 		 555 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.92 
 
 		 607 aa  360  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 		 598 aa  334  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.93 
 
 		 551 aa  300  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  37.65 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  34.58 
 
 		 234 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  37.89 
 
 		 239 aa  104  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 		 236 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.86 
 
 		 228 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  36.23 
 
 		 259 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  34.87 
 
 		 227 aa  100  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.02 
 
 		 235 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  36.84 
 
 		 239 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  32.18 
 
 		 231 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.18 
 
 		 231 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  36.65 
 
 		 241 aa  100  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.44 
 
 		 231 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  31.8 
 
 		 233 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  34.45 
 
 		 236 aa  99.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.94 
 
 		 231 aa  99.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  36.84 
 
 		 239 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  31.8 
 
 		 233 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  34.6 
 
 		 227 aa  98.6  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  34.5 
 
 		 222 aa  98.2  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  32.87 
 
 		 234 aa  98.2  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 		 243 aa  98.2  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  32.89 
 
 		 236 aa  97.8  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  34.31 
 
 		 236 aa  97.4  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  35.29 
 
 		 239 aa  97.8  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.37 
 
 		 229 aa  97.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  34.31 
 
 		 259 aa  97.4  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 		 221 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  34.25 
 
 		 257 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  32.06 
 
 		 231 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  30.14 
 
 		 231 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  32.06 
 
 		 231 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  32.06 
 
 		 231 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  33.49 
 
 		 235 aa  95.5  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  32.06 
 
 		 231 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.51 
 
 		 229 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  30.14 
 
 		 231 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  34.31 
 
 		 230 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  34.31 
 
 		 230 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  29.86 
 
 		 224 aa  95.5  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  29.86 
 
 		 224 aa  95.5  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.77 
 
 		 233 aa  95.1  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  32.98 
 
 		 231 aa  95.5  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 		 232 aa  94.7  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  33.79 
 
 		 257 aa  94.7  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.95 
 
 		 229 aa  94.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.88 
 
 		 227 aa  94.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.52 
 
 		 230 aa  94.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  33.49 
 
 		 236 aa  94.4  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  34.69 
 
 		 224 aa  94  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.65 
 
 		 228 aa  94  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.65 
 
 		 228 aa  94  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.65 
 
 		 228 aa  94  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.11 
 
 		 228 aa  94  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  34.67 
 
 		 224 aa  93.6  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  33.17 
 
 		 218 aa  93.6  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  31.65 
 
 		 228 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.66 
 
 		 218 aa  93.2  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  31.65 
 
 		 228 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  31.65 
 
 		 228 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.96 
 
 		 229 aa  93.2  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  30.38 
 
 		 263 aa  93.2  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.19 
 
 		 228 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  31.96 
 
 		 229 aa  92.8  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  30.99 
 
 		 231 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 		 230 aa  92.8  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  37.06 
 
 		 248 aa  92.8  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.67 
 
 		 225 aa  92  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.19 
 
 		 228 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  32.42 
 
 		 229 aa  91.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.56 
 
 		 229 aa  91.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  32.09 
 
 		 230 aa  91.3  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  31.91 
 
 		 229 aa  91.3  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  24.66 
 
 		 756 aa  90.9  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  24.66 
 
 		 756 aa  90.9  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  24.66 
 
 		 756 aa  90.9  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.66 
 
 		 224 aa  90.9  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.92 
 
 		 230 aa  90.9  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.92 
 
 		 230 aa  90.9  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.31 
 
 		 223 aa  90.5  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  33.66 
 
 		 228 aa  90.5  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.55 
 
 		 235 aa  90.5  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  34.33 
 
 		 230 aa  90.1  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.02 
 
 		 233 aa  90.1  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.04 
 
 		 224 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  34.02 
 
 		 233 aa  90.1  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>