More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20731 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_20731  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  289  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  91.59 
 
 
496 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3592  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
938 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10559  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3270  Osmosensitive K channel His kinase sensor  43.12 
 
 
938 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0289093  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  42.99 
 
 
910 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  41.28 
 
 
937 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
456 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  42.42 
 
 
927 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
895 aa  87  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  36 
 
 
897 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
897 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  40.2 
 
 
646 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  44.12 
 
 
484 aa  84.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
944 aa  84.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
639 aa  84.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43 
 
 
523 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  42.72 
 
 
466 aa  84  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
967 aa  84.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
1341 aa  84  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
533 aa  83.6  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
902 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  39.22 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  43.52 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
639 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  37.39 
 
 
910 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  40.2 
 
 
539 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
953 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  36.7 
 
 
909 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  42 
 
 
570 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  35.38 
 
 
300 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  33.82 
 
 
915 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  40.59 
 
 
588 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
945 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
546 aa  80.1  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
522 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.58 
 
 
895 aa  80.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
639 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
482 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
663 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4666  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
514 aa  79.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.782496  normal  0.233494 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
763 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
920 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
763 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  37.86 
 
 
913 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
429 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
412 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
488 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
546 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
372 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00620911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
382 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
928 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  38.61 
 
 
496 aa  77.8  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
1568 aa  77.8  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
499 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0083  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
874 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 
721 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  38.68 
 
 
477 aa  77.4  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
1207 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0025  histidine kinase  40.2 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000104347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
463 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  40.95 
 
 
502 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
1273 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
901 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  38.46 
 
 
903 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  35.58 
 
 
512 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  43.4 
 
 
498 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
499 aa  76.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
461 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.79 
 
 
1301 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
1267 aa  76.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
596 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  35.24 
 
 
469 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
763 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
557 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.41 
 
 
1396 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 
469 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0579  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
487 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721447  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
637 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
478 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  35.58 
 
 
895 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
951 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  39.6 
 
 
566 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
799 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  33 
 
 
471 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
463 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  35.48 
 
 
908 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
621 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  34.33 
 
 
524 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
640 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  36.52 
 
 
908 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
445 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
1162 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
463 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1580  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
478 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
500 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>