71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03231 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  100 
 
 		 451 aa  897    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  71.63 
 
 		 427 aa  581  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  68.33 
 
 		 423 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  58.13 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  58.13 
 
 		 425 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  61.4 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  47.07 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  45.5 
 
 		 421 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  44.79 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  45.61 
 
 		 462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  42.96 
 
 		 413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  42.58 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  42.58 
 
 		 423 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  40.24 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  40.19 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  38.48 
 
 		 413 aa  295  9e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  40.35 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 482 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  22.49 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  29.93 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  30.55 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  22.18 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  27.31 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  26.32 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  28.05 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  21.21 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2612  lipid-A-disaccharide synthase  25.75 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  28.23 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  21.22 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  25.3 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  22.47 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  25.91 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  24.05 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  25.34 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  27.62 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  22.41 
 
 		 384 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  27.62 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  25 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  25.52 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  25.1 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  23.28 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  22.76 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  28.36 
 
 		 377 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  25.75 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  25.1 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  25 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  31.69 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  22.81 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0132  hypothetical protein  26.67 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.195469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  24.71 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  28.5 
 
 		 380 aa  47.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  25.95 
 
 		 372 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  42.37 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0104  lipid-A-disaccharide synthase  32.84 
 
 		 355 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000837929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  22.04 
 
 		 376 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  25.3 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  25.39 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  25.39 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  25.39 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  25.57 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  25.39 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  24.22 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  23.38 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  25.57 
 
 		 375 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  24.66 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  25.39 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  25.39 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  22.13 
 
 		 380 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  24.8 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  27 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>