267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_12371 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  100 
 
 		 494 aa  1004    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  58.7 
 
 		 506 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  57.09 
 
 		 498 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  59.18 
 
 		 504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  57.83 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  58.57 
 
 		 494 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  55.96 
 
 		 509 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  55.31 
 
 		 495 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  53.54 
 
 		 509 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  54.27 
 
 		 510 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  49.49 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  48.48 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  48.9 
 
 		 495 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  48.9 
 
 		 495 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  49.19 
 
 		 491 aa  481  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  49.7 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  49.09 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  50.5 
 
 		 495 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  39.76 
 
 		 863 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  40.52 
 
 		 494 aa  348  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.63 
 
 		 503 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  38.67 
 
 		 515 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  40.55 
 
 		 503 aa  339  9e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  38.55 
 
 		 863 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  38.97 
 
 		 864 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  39.96 
 
 		 506 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  40.76 
 
 		 487 aa  333  4e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  39.8 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  39.56 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  38.76 
 
 		 503 aa  326  7e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  38.92 
 
 		 494 aa  326  7e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  37.87 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  39.96 
 
 		 777 aa  322  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  38.96 
 
 		 490 aa  322  8e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  38.6 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  39.8 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  37.38 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  37.43 
 
 		 518 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  37.2 
 
 		 852 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  38.79 
 
 		 797 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  38.09 
 
 		 514 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  37.11 
 
 		 551 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  37.8 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  35.49 
 
 		 539 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  39.36 
 
 		 495 aa  310  5e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  40.4 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  39.53 
 
 		 489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  36.06 
 
 		 511 aa  307  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  37.5 
 
 		 507 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  37.53 
 
 		 484 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  37.7 
 
 		 486 aa  306  7e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  38.69 
 
 		 512 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  37.91 
 
 		 532 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  37.37 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  37.93 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  39.18 
 
 		 481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  37.23 
 
 		 776 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  37.47 
 
 		 484 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  37.25 
 
 		 493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  39.15 
 
 		 478 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  37.95 
 
 		 500 aa  302  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  36.13 
 
 		 485 aa  303  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1259  cobyric acid synthase  38.55 
 
 		 491 aa  302  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.430253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  37.77 
 
 		 490 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  39.51 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  37.57 
 
 		 490 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  36.84 
 
 		 772 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  38.61 
 
 		 490 aa  300  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  37.28 
 
 		 513 aa  299  7e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  36.06 
 
 		 508 aa  299  9e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  36.67 
 
 		 509 aa  299  9e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  38.49 
 
 		 486 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  36.71 
 
 		 518 aa  297  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  37.58 
 
 		 787 aa  296  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  35.98 
 
 		 481 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  38.03 
 
 		 485 aa  295  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  36.87 
 
 		 858 aa  295  9e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  36.62 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  35.79 
 
 		 481 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  39.41 
 
 		 484 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  36.49 
 
 		 495 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  38.72 
 
 		 488 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2760  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  38 
 
 		 507 aa  293  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  36.29 
 
 		 485 aa  293  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  35.01 
 
 		 514 aa  292  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  36.51 
 
 		 505 aa  292  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  38.11 
 
 		 535 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  36.22 
 
 		 541 aa  292  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  36.69 
 
 		 483 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  38.49 
 
 		 545 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  37.92 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  37.92 
 
 		 585 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  37.92 
 
 		 529 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  37.92 
 
 		 523 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  35.97 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  37.92 
 
 		 531 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  37.85 
 
 		 483 aa  289  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  36.49 
 
 		 506 aa  289  8e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  34.82 
 
 		 529 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  36.29 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>