More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10941 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
266 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  73.44 
 
 
256 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  73.05 
 
 
256 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  72.37 
 
 
265 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.05 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  71.49 
 
 
260 aa  350  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.18 
 
 
251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.83 
 
 
249 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.31 
 
 
267 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.92 
 
 
249 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.16 
 
 
249 aa  291  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.83 
 
 
249 aa  291  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.41 
 
 
249 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.36 
 
 
267 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  55.6 
 
 
249 aa  287  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.52 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.77 
 
 
248 aa  281  6.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.78 
 
 
267 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.89 
 
 
246 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.08 
 
 
259 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  53.23 
 
 
257 aa  259  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50.6 
 
 
256 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.2 
 
 
266 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.55 
 
 
249 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.23 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
264 aa  242  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 
255 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 
252 aa  238  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
245 aa  236  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
256 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  47.01 
 
 
253 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.97 
 
 
259 aa  236  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  48.59 
 
 
252 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.85 
 
 
275 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.85 
 
 
275 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.98 
 
 
261 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  45.71 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  45.71 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  45.71 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.73 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  45.71 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
261 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  48.93 
 
 
248 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.51 
 
 
249 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  47.33 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.58 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.58 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.58 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.28 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
234 aa  232  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.28 
 
 
253 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  46.28 
 
 
252 aa  231  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.28 
 
 
253 aa  232  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.78 
 
 
256 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.28 
 
 
252 aa  231  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  47.5 
 
 
253 aa  232  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.6 
 
 
252 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.28 
 
 
253 aa  232  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.28 
 
 
252 aa  231  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.28 
 
 
253 aa  232  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.78 
 
 
256 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  46.28 
 
 
253 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.62 
 
 
252 aa  231  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  44.22 
 
 
275 aa  231  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  47.5 
 
 
253 aa  230  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  44.94 
 
 
253 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.06 
 
 
275 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.46 
 
 
257 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  46.69 
 
 
259 aa  230  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  45.31 
 
 
275 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
254 aa  229  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
266 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  47.21 
 
 
247 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
253 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
238 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.28 
 
 
252 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  45.64 
 
 
246 aa  228  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.38 
 
 
251 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
259 aa  228  6e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.9 
 
 
249 aa  228  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.58 
 
 
266 aa  228  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
261 aa  228  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.83 
 
 
252 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 
252 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.42 
 
 
252 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.91 
 
 
267 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
253 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
253 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
238 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  45.92 
 
 
264 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  45.65 
 
 
271 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.69 
 
 
256 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.75 
 
 
256 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
260 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1462  undecaprenyl diphosphate synthase  47.28 
 
 
259 aa  226  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.101817  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.29 
 
 
252 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 
239 aa  226  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>