More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02811 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  56.16 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  60.3 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  60.3 
 
 		 206 aa  245  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.27 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  54 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  56.37 
 
 		 207 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.94 
 
 		 207 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  55.17 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  52.97 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  51.83 
 
 		 202 aa  208  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  51.3 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  48.15 
 
 		 201 aa  201  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.35 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  48.68 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  48.44 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  48.44 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.16 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  44.33 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.88 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.19 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.86 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.56 
 
 		 223 aa  164  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.58 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  40.51 
 
 		 209 aa  157  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.26 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  39.38 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  35.5 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  40.94 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  43.51 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3335  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.34 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.16 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  33.5 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  40.74 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  38.51 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  34.81 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  38.85 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.79 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  34.69 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.08 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  34.17 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  34.39 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  34.39 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  34.39 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  42.97 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  33.5 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  38.16 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  36.18 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  34.57 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  38.1 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  41.22 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.98 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  40.15 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  42.75 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  33.93 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  33.15 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  32.83 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.82 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  32.6 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  34.39 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  34.81 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  35.03 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1295  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.62 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  36.31 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  34.18 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  34.18 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  34.03 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  34.18 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  34.18 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.54 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  33.54 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  37.65 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  35.67 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  33.15 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  34.39 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  36.94 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  32.11 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  32.11 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  35.67 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  34.34 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  33.02 
 
 		 216 aa  101  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  35.67 
 
 		 200 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  32.49 
 
 		 200 aa  101  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2092  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  38.51 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  44.07 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1325  isopropylmalate isomerase small subunit  34.39 
 
 		 193 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0014  isopropylmalate isomerase small subunit  33.16 
 
 		 200 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  39.69 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1173  isopropylmalate isomerase small subunit  38.3 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  33.15 
 
 		 193 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  40.46 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  33.76 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  34.87 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  34.87 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1899  isopropylmalate isomerase small subunit  43.22 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>