243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4259 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 365 aa  747    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  68.87 
 
 		 366 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  66.03 
 
 		 372 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  65.75 
 
 		 365 aa  487  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  62.84 
 
 		 366 aa  480  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  65.21 
 
 		 367 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  62.53 
 
 		 368 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  57.02 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  52.49 
 
 		 359 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  46.07 
 
 		 360 aa  298  8e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  37.71 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  37.78 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  37.14 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  38.42 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  37.68 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  36.65 
 
 		 339 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  35.36 
 
 		 340 aa  188  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  35.88 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  34.94 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  33.71 
 
 		 590 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  34.88 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  30.95 
 
 		 344 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  34.77 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  32.66 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  33.14 
 
 		 330 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  29.55 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  30.37 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.57 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.63 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  31.61 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  30.52 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.57 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.22 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  29.13 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  31.73 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  29.45 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  29.46 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  28.82 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  26.82 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  29.63 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  27.37 
 
 		 351 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  25.43 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  28.33 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  28.78 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  28.86 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  28.7 
 
 		 342 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  25.74 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.94 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  26.5 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  28.24 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  26.76 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.21 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  26.21 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  26.21 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  25.93 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.93 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  28.32 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  26.21 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  25.07 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  25.92 
 
 		 338 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  28.14 
 
 		 317 aa  92.8  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  25.14 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  26.36 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  24.38 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  29.51 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  25.23 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  24.67 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  26.84 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.75 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  24.57 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  27.07 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  25.42 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  27.51 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  26.01 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  25.49 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  25.53 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  24.86 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  23.61 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  27.35 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  25.21 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  25.63 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  24.86 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  25.14 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  24.92 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  25.14 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  23.82 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  22.51 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  25.21 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  25.58 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  21.08 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  22.87 
 
 		 643 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  23.12 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  25.38 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  25.64 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  25.38 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  23.4 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  22.32 
 
 		 628 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>