More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2482 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
644 aa  1305    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  49.16 
 
 
358 aa  346  7e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  44.23 
 
 
356 aa  317  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0458  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.49 
 
 
266 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2266  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.29 
 
 
266 aa  206  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00648615  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 
369 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 
373 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 
368 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  36.77 
 
 
372 aa  179  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  37.24 
 
 
379 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  36.24 
 
 
366 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 
366 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  36.54 
 
 
366 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 
373 aa  175  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  34.57 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  35.26 
 
 
383 aa  174  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  38.58 
 
 
375 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 
366 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  37.22 
 
 
374 aa  171  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 
367 aa  170  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  35.97 
 
 
379 aa  170  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
375 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 
368 aa  163  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 
366 aa  163  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  35.16 
 
 
379 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  35.12 
 
 
373 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  33.05 
 
 
380 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  32.97 
 
 
370 aa  153  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 
368 aa  151  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  31.46 
 
 
657 aa  150  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 
377 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  29.92 
 
 
379 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 
382 aa  147  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
388 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 
364 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
368 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 
377 aa  144  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  34.8 
 
 
665 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 
380 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  30.73 
 
 
377 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  32.51 
 
 
357 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 
357 aa  141  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  33.15 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  35.06 
 
 
378 aa  140  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  31.34 
 
 
365 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  36.09 
 
 
368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.58 
 
 
378 aa  135  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.58 
 
 
378 aa  135  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  30.75 
 
 
377 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
382 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 
378 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  35.69 
 
 
371 aa  124  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
369 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  33.88 
 
 
383 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  36.76 
 
 
376 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
352 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 
363 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
372 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.75 
 
 
382 aa  94.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 
377 aa  90.9  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 
350 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.78 
 
 
428 aa  89.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
345 aa  89  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
385 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.65 
 
 
329 aa  87  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2497  oxidoreductase domain-containing protein  26.26 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 
321 aa  84  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 
665 aa  84  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 
383 aa  83.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3179  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
334 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  27.82 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2847  oxidoreductase domain-containing protein  25.76 
 
 
372 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.7 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  21.99 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  21.99 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 
345 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 
347 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.96 
 
 
670 aa  75.1  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  27.74 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  29.74 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24.91 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  27.85 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  28.3 
 
 
337 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
337 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>