54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2178 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.45 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  28.99 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  29.41 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.37 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  30.4 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  28 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.05 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25.73 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 		 252 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  27.5 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.38 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25.48 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.37 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  27.88 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.11 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.44 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  27.5 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  26.55 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  24.14 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.27 
 
 		 246 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  27.27 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  27.27 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.22 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.11 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.55 
 
 		 755 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  27.16 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  23.21 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  27.19 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  23.78 
 
 		 255 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  23.64 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  29.13 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  33.77 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  26.15 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  36.47 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  24.43 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  32.58 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  23.96 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  22.28 
 
 		 361 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  23.46 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  22.91 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  31.75 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  25.58 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  29.89 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  25.45 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  25.6 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  24.48 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  28.26 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>