More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0419 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  100 
 
 
441 aa  877    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  56.52 
 
 
437 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  53.58 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  53.35 
 
 
437 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  56.75 
 
 
436 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  57.31 
 
 
437 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  56.9 
 
 
441 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  59.25 
 
 
436 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  53.24 
 
 
434 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  55.69 
 
 
442 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  53.79 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  56.97 
 
 
489 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  53.85 
 
 
442 aa  450  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  59.04 
 
 
439 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  53.46 
 
 
443 aa  450  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  51.58 
 
 
437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  53.9 
 
 
426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  56.28 
 
 
433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  51.53 
 
 
442 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  56.05 
 
 
454 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  53.9 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  54.31 
 
 
422 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  52.53 
 
 
435 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  53.41 
 
 
427 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  55.21 
 
 
441 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  52.76 
 
 
434 aa  428  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  51.75 
 
 
434 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  51.75 
 
 
434 aa  425  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  54.07 
 
 
449 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.11 
 
 
441 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  51.05 
 
 
439 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.05 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  52.11 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  52.8 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  53.95 
 
 
450 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  52.52 
 
 
453 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  50.24 
 
 
432 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  51.42 
 
 
443 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.23 
 
 
474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  51.04 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  51.82 
 
 
442 aa  405  1e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  54.95 
 
 
441 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  50.57 
 
 
440 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  51.68 
 
 
440 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  49.77 
 
 
440 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  51.43 
 
 
435 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  52.26 
 
 
437 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  55.4 
 
 
439 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  51.91 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  50.23 
 
 
468 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  50.24 
 
 
439 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  46.72 
 
 
504 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  51.54 
 
 
448 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  51.07 
 
 
459 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  50.23 
 
 
438 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  50.23 
 
 
438 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  54.39 
 
 
460 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  49.08 
 
 
470 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  48.97 
 
 
442 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  50.56 
 
 
446 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  49.31 
 
 
454 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  48.21 
 
 
446 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  48.41 
 
 
475 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  48.26 
 
 
439 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  45.81 
 
 
472 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  48.05 
 
 
441 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  48.05 
 
 
446 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  50.47 
 
 
448 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  48.67 
 
 
485 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  48.38 
 
 
524 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  49.88 
 
 
441 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.08 
 
 
439 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  47.82 
 
 
441 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  47.81 
 
 
440 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  46.95 
 
 
456 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  46.62 
 
 
549 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  48.08 
 
 
439 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  47.98 
 
 
456 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  49.66 
 
 
445 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  47.72 
 
 
445 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  48.92 
 
 
446 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  48.26 
 
 
449 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  47.85 
 
 
519 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  50.84 
 
 
434 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  46.62 
 
 
552 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  51.82 
 
 
437 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  47.98 
 
 
456 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  48.15 
 
 
513 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  46.82 
 
 
444 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  48.15 
 
 
514 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  47.98 
 
 
456 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  47.98 
 
 
456 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  48.15 
 
 
513 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  47.98 
 
 
456 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  47.62 
 
 
513 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  49.08 
 
 
446 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  47.13 
 
 
445 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  46.76 
 
 
439 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  48.17 
 
 
488 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  45.96 
 
 
454 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>