More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2800 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
286 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  44.89 
 
 
280 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4082  extracellular solute-binding protein  45.6 
 
 
280 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  43.37 
 
 
273 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4454  extracellular solute-binding protein  45.16 
 
 
280 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160323  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0439  extracellular solute-binding protein  35.79 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.501254  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1310  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 
303 aa  191  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817275 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  32.27 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  33.91 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30.15 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
285 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  31.02 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  30.89 
 
 
266 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  31.42 
 
 
265 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
253 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  32.19 
 
 
266 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  32.19 
 
 
266 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.76 
 
 
266 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.76 
 
 
266 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.76 
 
 
266 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  29.91 
 
 
266 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  29.91 
 
 
266 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  29.91 
 
 
266 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  30.08 
 
 
317 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 
256 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.86 
 
 
266 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.61 
 
 
265 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2743  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 
276 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0284405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
260 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5603  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 
276 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
281 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2099  ABC transporter substrate-binding protein  32.27 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0246  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.469708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02234  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  28.92 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.92 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1343  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.92 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.908604  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  30.29 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2603  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  28.92 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02194  hypothetical protein  28.92 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2465  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  28.92 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3449  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  28.92 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2459  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  28.92 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2687  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  28.92 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0240  extracellular solute-binding protein family 3  27.97 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551221  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 
295 aa  95.9  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
273 aa  96.3  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
249 aa  95.9  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0723  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
276 aa  95.9  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527134  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.28 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.28 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.28 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.28 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2495  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.92 
 
 
260 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.89405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2583  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.92 
 
 
260 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.17472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.28 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2595  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.92 
 
 
260 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473996  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2704  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.92 
 
 
260 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2541  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  28.92 
 
 
260 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.863466  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  27.69 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1953  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.77 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.86 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.86 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 
254 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.28 
 
 
265 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2858  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.23 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.86 
 
 
265 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  29.11 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 
251 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
287 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  28.7 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.63 
 
 
260 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.33 
 
 
244 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.12 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0401  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0301  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.14 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.52 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1879  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.38 
 
 
281 aa  93.2  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
247 aa  92.8  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>