More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0301 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0301  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1602  extracellular solute-binding protein  74.38 
 
 		 258 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0401  extracellular solute-binding protein  68.77 
 
 		 254 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0240  extracellular solute-binding protein family 3  66.8 
 
 		 253 aa  348  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551221  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0246  extracellular solute-binding protein  66.8 
 
 		 253 aa  348  6e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.469708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  64.1 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00359  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  63.52 
 
 		 255 aa  322  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  52.3 
 
 		 272 aa  261  8.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  54.08 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 		 260 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.13 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  34.14 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.73 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  31.33 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.33 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.33 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  31.33 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  33.33 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.12 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.92 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  35.04 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.54 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.12 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  35.27 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 257 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  34.33 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  34.33 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.87 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.02 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.87 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.94 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.94 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.94 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.94 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.55 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.55 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  33.07 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  32.66 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.55 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  33.05 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.23 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.62 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  31.62 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.85 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  32.16 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  32.14 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.23 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.23 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.23 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2998  extracellular solute-binding protein family 3  31.97 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.23 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  35.48 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.23 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.04 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.59 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.65 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.17 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  28.91 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  37.44 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  30.84 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  36.53 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.83 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.01 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.01 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.01 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>