80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1854 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  273  8e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  43.51 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  34.62 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  28.46 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  27.14 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 181 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  29.25 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  24.46 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 201 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 149 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 171 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  27.12 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.91 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  29.63 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.63 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  29.63 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  29.63 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 146 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.63 
 
 		 145 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.63 
 
 		 145 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>