55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1480 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  100 
 
 		 120 aa  251  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  55.86 
 
 		 118 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  59.46 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  55.86 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  54.05 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  53.64 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  50.45 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  47.47 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  56.34 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  49.41 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  53.75 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  52.5 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  40.52 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  46.53 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  45.45 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  47.13 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  37.72 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0335  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  40.59 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1722  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  39.6 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2023  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  40.59 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163439  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  46.48 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  42 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  47.22 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  55.38 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  43.9 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0864  Restriction endonuclease protein  37.5 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  51.52 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  36.54 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  37.76 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  48.48 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  48.48 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  53.85 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  47.37 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  46.97 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  46.05 
 
 		 299 aa  57  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  32.71 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  38.84 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  33.67 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  58.97 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  43.28 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  43.28 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  38.2 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  36.59 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 132 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  39.68 
 
 		 113 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  42.19 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  37.84 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>