More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1854 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
396 aa  820    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.46 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.89 
 
 
387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  30.69 
 
 
753 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  31.98 
 
 
411 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  29.18 
 
 
393 aa  152  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.61 
 
 
422 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.02 
 
 
395 aa  142  8e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.37 
 
 
410 aa  140  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.23 
 
 
431 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.78 
 
 
433 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.47 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  29.66 
 
 
385 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  28.69 
 
 
404 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 
411 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  29.61 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.07 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  33.33 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.43 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  30.99 
 
 
422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.81 
 
 
385 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.82 
 
 
417 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  28.93 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  29.86 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.16 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  27.74 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  27.7 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  27.82 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  26.99 
 
 
389 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  26.99 
 
 
405 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  26.99 
 
 
405 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  26.99 
 
 
405 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  26.99 
 
 
405 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  31.87 
 
 
416 aa  131  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  26.99 
 
 
389 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  28.3 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  28.76 
 
 
392 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  26.9 
 
 
586 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.16 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.27 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 
406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  30.75 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  28.03 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 
422 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 
387 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  26.67 
 
 
369 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 
422 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  28.85 
 
 
406 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3265  acetylornithine deacetylase  28.02 
 
 
416 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.366543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  27.32 
 
 
368 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  27.86 
 
 
419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  28.49 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  28.09 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  30.32 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  27.41 
 
 
399 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 
423 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  30.46 
 
 
422 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  31.32 
 
 
422 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.57 
 
 
392 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 
390 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 
406 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 
406 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.3 
 
 
398 aa  126  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.31 
 
 
389 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.86 
 
 
439 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.37 
 
 
423 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
397 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  28.7 
 
 
404 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  28.25 
 
 
406 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.16 
 
 
435 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.94 
 
 
402 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  27.4 
 
 
376 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 
397 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  27.73 
 
 
406 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.62 
 
 
391 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  28.49 
 
 
406 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 
376 aa  123  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  28.49 
 
 
406 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  29.02 
 
 
341 aa  122  9e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.9 
 
 
398 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  28.77 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  28.74 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.62 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.78 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  29.91 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  29.73 
 
 
379 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.12 
 
 
424 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  26.67 
 
 
384 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  28.19 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  28.19 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  27.17 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  28.19 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  26.46 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>