More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4485 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4485  ROK family protein  100 
 
 		 305 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1048  ROK family protein  51.18 
 
 		 361 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3734  ROK family protein  51.49 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258087  decreased coverage  0.00194225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  36.01 
 
 		 336 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  35.96 
 
 		 386 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.14 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  39.13 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  35.02 
 
 		 391 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  32.39 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  37.89 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  36.62 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  36.62 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.04 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  35.62 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  38.46 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.05 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  32.75 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.62 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  35.64 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  30.21 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  36.73 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  35.2 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29.93 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  38.83 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  31.72 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  34.16 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.49 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  29.97 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  36.53 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  34.88 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  36.63 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  35.2 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.89 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  37.23 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  35.33 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  34.54 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  35.93 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  24.84 
 
 		 385 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3719  D-allose kinase  30.3 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  34.38 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  41.27 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.18 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.18 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  34.95 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  39.64 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.27 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  35.94 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  38.79 
 
 		 395 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  35.11 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  30.45 
 
 		 434 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  35.89 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  35.27 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  26.97 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  35.56 
 
 		 360 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  38.3 
 
 		 401 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  31.51 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  33.07 
 
 		 409 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  34.23 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  32.74 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  36.54 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.11 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  34.84 
 
 		 361 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  30.56 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.33 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.32 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  37.25 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.32 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.36 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  38.49 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  34.52 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  27.87 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  33.46 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  33.66 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  38.01 
 
 		 401 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  36.32 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  33.86 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  32.31 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  31.87 
 
 		 478 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  31.65 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  31.65 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  31.65 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  31.65 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  31.65 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  31.65 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  35.31 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  31.65 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  39.32 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  38.21 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  35.46 
 
 		 317 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.16 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  35.53 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  37.84 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  35.68 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  33.61 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  34.53 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  33.33 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  38.92 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  35.71 
 
 		 387 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>