More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0533 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
533 aa  1028    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  58.95 
 
 
521 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  54.8 
 
 
525 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.42 
 
 
516 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0280  NADH dehydrogenase subunit N  55.51 
 
 
519 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  56.31 
 
 
511 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  57.36 
 
 
516 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1872  NADH dehydrogenase subunit N  56.19 
 
 
523 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  54.92 
 
 
524 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  54.73 
 
 
524 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  54.92 
 
 
524 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  52.09 
 
 
531 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2682  NADH dehydrogenase subunit N  56.41 
 
 
549 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  52.18 
 
 
557 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  55.41 
 
 
527 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4545  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.42 
 
 
515 aa  485  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4052  NADH dehydrogenase subunit N  52.52 
 
 
517 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4450  NADH dehydrogenase subunit N  52.34 
 
 
517 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  52.5 
 
 
531 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  51.24 
 
 
523 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  48.71 
 
 
524 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0389  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.22 
 
 
572 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5066  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.51 
 
 
550 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146495  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  50 
 
 
527 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.89 
 
 
577 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2703  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.57 
 
 
565 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  48.55 
 
 
566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0552  NADH dehydrogenase subunit N  42.04 
 
 
595 aa  395  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07510  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.6 
 
 
601 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0423349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.79 
 
 
489 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.2 
 
 
487 aa  317  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.32 
 
 
484 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.31 
 
 
487 aa  309  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.64 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.83 
 
 
484 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  38.84 
 
 
484 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.55 
 
 
489 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.55 
 
 
491 aa  270  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.66 
 
 
476 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.15 
 
 
492 aa  260  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  40.75 
 
 
497 aa  257  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2538  NADH dehydrogenase subunit N  37.61 
 
 
485 aa  257  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.97 
 
 
476 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  38.46 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1572  NADH dehydrogenase subunit N  35.71 
 
 
487 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1466  NADH dehydrogenase subunit N  35.71 
 
 
487 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.73 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.29 
 
 
483 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1804  NADH dehydrogenase subunit N  35.52 
 
 
487 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0242179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  38.81 
 
 
490 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.46 
 
 
483 aa  253  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  40.69 
 
 
478 aa  252  9.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  40.69 
 
 
478 aa  252  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.76 
 
 
482 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.34 
 
 
457 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  38.56 
 
 
490 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  35.8 
 
 
485 aa  250  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  35.34 
 
 
485 aa  250  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  39.04 
 
 
493 aa  250  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  37.81 
 
 
485 aa  249  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2500  NADH dehydrogenase subunit N  35.55 
 
 
485 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  38.06 
 
 
490 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  38.06 
 
 
490 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2544  NADH dehydrogenase subunit N  35.55 
 
 
485 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  38.06 
 
 
485 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  38.06 
 
 
485 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  38.06 
 
 
485 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  38.06 
 
 
490 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2555  NADH dehydrogenase subunit N  35.55 
 
 
485 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.968659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  38.06 
 
 
490 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.55 
 
 
485 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  35.55 
 
 
485 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  35.07 
 
 
485 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  35.55 
 
 
485 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2455  NADH dehydrogenase subunit N  35.55 
 
 
485 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.756479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3296  NADH dehydrogenase subunit N  35.26 
 
 
485 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  35.55 
 
 
485 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  35.55 
 
 
485 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  35.74 
 
 
485 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2662  NADH dehydrogenase subunit N  35.35 
 
 
485 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0819952  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.82 
 
 
511 aa  247  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0974  NADH dehydrogenase subunit N  38.89 
 
 
491 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  38.8 
 
 
476 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  40.56 
 
 
480 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  35.35 
 
 
485 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  38.26 
 
 
478 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  38.07 
 
 
488 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.56 
 
 
477 aa  246  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  38.07 
 
 
478 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  37.82 
 
 
488 aa  246  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  39.42 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  38.67 
 
 
494 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.9 
 
 
491 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.9 
 
 
491 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  37.68 
 
 
494 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.9 
 
 
491 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0970  NADH dehydrogenase subunit N  40.25 
 
 
497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal  0.32361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  37.12 
 
 
489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.27 
 
 
500 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  37.12 
 
 
488 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>