More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0204 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  100 
 
 		 325 aa  644    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  45.91 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  47.39 
 
 		 288 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  48.86 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  44.06 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  44.06 
 
 		 293 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  45.99 
 
 		 295 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  45.05 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  41.43 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  46.35 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  41.81 
 
 		 294 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  38.57 
 
 		 288 aa  222  7e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  45.29 
 
 		 284 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  43.97 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  39.36 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  43.35 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  46.43 
 
 		 289 aa  215  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  42.05 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  44.48 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  44.48 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  43.75 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  38.55 
 
 		 284 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  38.55 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  38.91 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  38.55 
 
 		 284 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  39.1 
 
 		 285 aa  209  6e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.25 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  38.6 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  41.84 
 
 		 301 aa  207  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  45.77 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  42.03 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  46.26 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.42 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  40.61 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  39.74 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  42.12 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  43.06 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  48.15 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  39.8 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  40.54 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  41.07 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  42.31 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  41.92 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  38.95 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  38.65 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  38.65 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  38.3 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  38.3 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  38.3 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  38.3 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  37.59 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  38.3 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  46.3 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  38.65 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  38.3 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  39.01 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  39.05 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  37.63 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4325  2,3-dimethylmalate lyase  45.75 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  37.24 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  37.78 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  37.63 
 
 		 291 aa  185  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  39.54 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1122  2-methylisocitrate lyase  39.44 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  39.54 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  39.16 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  39.16 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.16 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  39.35 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  37.36 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  38.63 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  37.59 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.16 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.16 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  36.27 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  39.16 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  36.9 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  35.93 
 
 		 296 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  36.82 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  36.9 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  37.02 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  36.9 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  39.16 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.16 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.16 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  36.93 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  38.85 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  36.55 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  38.52 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  37.63 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  36.08 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  37.59 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  37.59 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  37.59 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  37.59 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  39 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  35.93 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  37.46 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  37.23 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  40.65 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>