280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2235 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2235  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2900  electron transport protein SCO1/SenC  56.47 
 
 		 196 aa  205  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  30.69 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  37.7 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  39.17 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  30.46 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  36.89 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  33.09 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  33.81 
 
 		 181 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  33.81 
 
 		 181 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  33.81 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  33.81 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  33.81 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  33.81 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  33.81 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  37.1 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  31.29 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  35.38 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  36.8 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  34.43 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  38.84 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  34.17 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  34.44 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  36.29 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  32.79 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  32.23 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  32.79 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  34.38 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  33.33 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  27.98 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  33.1 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  31.69 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  34.82 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  28.41 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  32.77 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  35.25 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  32.31 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  31.4 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  30.33 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  32.79 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  30.22 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  33.93 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  31.88 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  33.93 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  27.78 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  33.06 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  35.34 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  35.34 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  30.58 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  33.88 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  29.23 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  35 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  30.08 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  32.31 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  34.69 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  31.15 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  32.06 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
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NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  30.53 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  33.08 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
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